Awalnya, madrasah ini merupakan bagian dari Pendidikan Guru Agama Negeri (PGAN) 4 tahun. Setelah diterbitkannya Surat Keputusan Menteri Agama nomor 16 tahun 1978, tanggal 16 Maret 1978, sekolah ini resmi menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri 1 Bukittinggi. Saat itu tenaga pendidik dan tenaga kependidikan berasal dari PGAN 4 Tahun.

Pada awal berdirinya, madrasah ini mempunyai 2 unit gedung yang terdiri dari 6 ruang belajar. Pembangunan sarana selanjutnya dengan menggunakan dana APBN dan bantuan ADB.

1. Pembangunan 5 unit ruang belajar dibiayai APBN 1994.
2. Pembangunan 3 unit ruang belajar yang dibiayai APBN 1990
3. Pembangunan 3 unit ruang belajar yang dibiayai APBN 1994
4. Pembangunan gedung dalam kurun waktu 1994 s.d. 1996 dibangun gedung Kantor Kepala Madrasah, Kantor Majelis Guru, Perpustakaan, Laboratorium IPA, Laboratorium Bahasa, Laboratorium Komputer, Mushalla, Ruang Keterampilan dibiayai dengan APBN dan bantuan ADB.
5. Pembangunan 2 unit ruang belajar yang yang dibiayai oleh APBN tahun 2010 s.d. 2011.

Dalam perjalanannya hingga sekarang, MTsN 1 Bukittinggi telah dipimpin oleh 9 orang kepala madrasah. Berikut ini adalah kepala madrasah dan Plt. Kepala yang pernah memimpin dari tahun 1970 hingga sekarang :

1. Drs. Zulkarnain (1970 s.d. 1982)
2. Drs. Muslim (1983 s.d. 1989)
3. Dra. Lasmiwati (1989 s.d. 1991
4. Dra. Hj. Yusnimar M. (1991 s.d. 1998)
5. Drs. Yoesrizal Oemar (1998 s.d. 2001)
6. Drs. H. Syafril A. (2001 s.d. 2007)
7. Hj. Aisyah S., S.Ag., M.Pd. (2007 s.d. 2014)
8. Drs. Irsyad, M.Pd. (2014 s.d. 2016)
9. Sulani, S.Pd. (Plt. Kepala, 2016 s.d. 2017)
10. Dra. Hj. Eva Anggraini, M.Si. (2017 s.d. sekarang)